GST下拉实验（GST-pull down）是鉴定蛋白质间相互作用的一种常见方法，通常用于检测GST（谷胱甘肽S-转移酶）标记的蛋白质与靶蛋白的相互作用。在实验过程中，可能会出现一些常见问题，下面是GST下拉实验（GST-pull down）的常见问题及解答：

1、GST下拉实验（GST-pull down）的优缺点是什么？

GST下拉实验（GST-pull down）具有高灵敏度、特异性较高和检测范围较广的特点，是一种简单易行、经济实惠的技术。但该方法也有一些缺点，比如在检测抗原含量较低时可能会出现误差较大的情况，而且不能对蛋白质的结构和功能进行直接检测和确认，只能检测直接相互作用的两个蛋白，间接互作的蛋白无法检测。

2、如何减少GST下拉实验（GST-pull down）中的假阳性结果？

假阳性结果主要是由于自发形成的聚集态，不特异的吸附和其他非特异性相互作用引起的。为了减少GST-pull down中的假阳性结果，我们通过添加更多的非离子型洗涤剂和用特定的pH缓冲液来消除这些非特异性的互作，同时在检测前应该用0.1％的Tween-20（或其他洗涤剂）处理GST-beads。

3、如何选择适合的阴性对照组？

阴性对照组选用不含目的蛋白的空GST蛋白，这样可以帮助评估GST beads的特异性并排除一些假阳性的结果。

4、GST下拉实验（GST-pull down）的温度和时间应该如何选择？

GST下拉实验（GST-pull down）全程实验温度通常为4 ℃，时间为2-4小时。但是在不同的实验情况下，这些参数可能需要调整。

5、co-IP能验证到互作，为什么GST下拉实验（GST-pull down）却验证不到？

由于co-IP是在组织体内进行的实验，可能两个蛋白的互作是基于另外一个蛋白作为桥梁而发生的间接互作，而GST下拉实验只能证明两个蛋白直接互作，所以缺失了中间桥梁，两个目的蛋白自然就不会呈现互作状态了。