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基于分子对接的虚拟筛选

2024/10/23

基于分子对接的虚拟筛选


基于分子对接的虚拟筛选技术原理简介

  分子对接是一种基于靶标蛋白三维结构的药物筛选方式。通过小分子化合物与靶标进行分子对接,综合分析得分及空间构象情况,包括静电作用、氢键作用、疏水作用、范德华作用等性质,可以探索配体小分子与受体生物大分子具体作用方式和结合构型,解释化合物产生活性的原因,为合理地优化化合物结构提供指导;通过结合亲合性打分函数,小分子化合物与靶蛋白的结合能力可以定量地得到评价,为候选化合物的挑选捉供依据,筛选潜在活性化合物,为实验提供参考。基于分子对接的小分子化合物的虚拟筛选是目前较有潜力的药物开发工具,由于分子对接过程对化合物结构并没有限制,基于分子对接的虚拟选完全有可能获得结构新颖的先导化合物。可以有效的节约时间和费用,这对于发展创新药物无疑起到积极的推动作用


适用范围

  分子对接:运用AutoDock Vina进行蛋白-小分子、蛋白-蛋白的分子对接,综合分析空间构象。
  小分子药物筛选:基于分子对接,对海量的小分子进行个性化的虚拟筛选,提高先导化合物的命中率。