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Nat Commun顶刊成果!辣椒CaKAN3-CaHSF8“差异结合”,破解HTHH胁迫下“耐热-免疫”协调难题

2025/9/30

在全球气候变化背景下,高温高湿(HTHH)已成为制约农业生产的关键复合胁迫因子,它既会直接引发植物热损伤,又会削弱免疫系统增加病原菌侵染风险,而植物如何在这种贴近田间实际的胁迫下协调 “耐热” 与 “免疫” 两大核心反应,其分子机制长期未明。今天和大家分享一篇关于聚焦辣椒抗逆机制研究的文章,该文章于20237月发表在nature communications杂志上,标题为“Differential CaKAN3-CaHSF8 associations underlie distinct immune and heat responses under high temperature and high humidity conditions”。

01. 研究思路

该研究针对高温高湿(HTHH)下茄科作物“耐热 - 免疫”协调机制空白的问题展开:先从辣椒“HTHH +青枯菌”处理的RNA-seq数据中,筛选出仅在HTHH相关条件下上调、定位于细胞核的CaKAN3(原涉发育)与CaHSF8(原涉耐热)。通过VIGS沉默与烟草过表达实验,证实二者均为HTHH下抗青枯菌免疫的正调控因子,仅 CaHSF8参与极端高温耐热。再用IP-MS、BiFC、MST、CoIP 等技术解析互作机制,证实两者在HTHH早期(1-3h)或中温(31-37℃)下于细胞核内依赖CaHSF8的 HR-A/B结构域与CaKAN3全长互作,HTHH后期(6h)或极端高温(45℃)下互作消失,且免疫调控需二者协同、耐热中CaHSF8可独立作用。经ChIP-seq及验证,二者共激活6个含特定基序的NLR免疫靶基因,CaHSF8单独激活4个HSP耐热靶基因。最终构建模型:HTHH早期有病原菌时,二者互作激活 NLR启动免疫;后期无病原菌或极端高温时,互作解离,CaHSF8单独激活HSP启动耐热,首次揭示转录因子“差异结合”介导的抗逆调控机制。

02. 主要研究内容

(1)CaKAN3 与 CaHSF8 相互作用

为筛选潜在调控蛋白,我们以“经28℃、90%湿度或37℃、90%湿度条件下青枯菌(RSI)处理的CaKAN3-GFP瞬时过表达辣椒叶片”为材料,提取CaKAN3-GFP蛋白进行IP-MS分析;结果显示,在37℃、90%湿度+RSI条件下,共获得10个高置信度的CaKAN3潜在互作蛋白。经 BiFC 实验初步验证筛选出CaHSF8,后续通过MST实验、Pull-down 实验及CoIP实验进一步验证。所有数据证实CaKAN3与CaHSF8存在互作,且BiFC实验显示二者互作发生于细胞核内。通过构建3 个CaHSF8缺失突变体与 1 个CaKAN3缺失突变体,结合Pull-down实验分析互作必需结构域,结果显示 CaHSF8缺失突变体D3与CaKAN3均不互作,CaKAN3缺失突变体CaKAN3myb与 CaHSF8也不互作,表明CaHSF8的HR-A/B结构域及CaKAN3全长是二者互作的必需条件。

(2)用ChIP测序法测定CaKAN3和CaHSF8的DNA结合位点

为探究作用模式,我们以“37℃、90%湿度+青枯菌(RSI)处理的CaKAN3或CaHSF8 过表达辣椒叶片”为材料提取染色质,通过ChIP-seq确定二者DNA结合位点:CaKAN3有10661个高置信度结合位点(关联717个基因),CaHSF8有36473个(关联2337个基因,p<0.05);二者超89%结合峰位于远端基因间区,仅7-8%在靶基因启动子区。比较发现199个重叠结合峰,富集于植物-病原菌互作等通路。利用 DREME/MEME软件,鉴定出CaKAN3保守结合序列AACAA、CaHSF8保守结合序列 TTCTAGAA;EMSA实验显示,CaKAN3-GST可结合3×AACAA,突变序列3×AAAAA 无结合,且3×AACAA驱动的GUS活性在37℃、90%湿度下因CaKAN3-HA过表达增强,28℃、90%湿度下减弱。同理,CaHSF8可结合TTCTAGAA,其过表达在两种温湿度下均增强3×HSE驱动的GUS活性,表明二者分别通过AACAA、HSE调控靶基因。酵母单杂交实验显示,CaHSF8(及阳性对照CabZIP6369)有转录活性,CaKAN3无转录活性。

(3)CaHSF8 以温度依赖性方式与 CaKAN3 发生差异结合,从而协同激活高湿高温(HTHH)特异性免疫反应与耐热性

通过BiFC、Nluc/Cluc 实验发现:二者在28℃、34℃、37℃处理1h及37℃处理1-3h互作,37℃6h及45℃各时间点均无互作,MST、CoIP验证与之一致,证实HTHH早期二者特异性互作。与28℃、90%湿度(RTHH)相比,45℃或37℃3h后CaHSF8对6个NLR基因的激活受抑,而4个HSP基因在45℃或37℃长期处理下上调,且CaHSF8过表达在HTHH/RSHT下1-6h均上调HSP基因。此外,CaHSF8在28℃、37℃可结合NLR启动子,45℃不可,却在37℃6h及45℃各时间点结合HSP启动子;CaKAN3在三种温湿度下均结合NLR启动子,结合亲和力无显著时间差异。以上表明,CaHSF8通过温度依赖性差异结合CaKAN3,分别激活高温特异性免疫与耐热性。

03. 参考文献

Yang S, Cai W, Wu R, et al. Differential CaKAN3-CaHSF8 associations underlie distinct immune and heat responses under high temperature and high humidity conditions. nature communications. 2023 Jul 25;14:4477. doi: 10.1038/s41467-023-40251-8